Wat is een oligonucleotide?

Een oligonucleotide is een korte keten van DNA of RNA moleculen die vele toepassingen in de moleculaire biologie en geneeskunde. Het wordt gebruikt als een probe om te screenen op ziekten, virale infecties, en genen in moleculaire biologie experimenten identificeren. Het wordt ook gebruikt als een primer in een soort DNA sequencing.

Om een ​​oligonucleotide begrijpen, helpt de structuur van DNA begrijpen. DNA-moleculen zijn erg lang rollen van twee strengen van vier verschillende nucleotide onderkasten aangebracht in verschillende orders. Elke unit heeft een complementaire base zal binden, zodat elke streng heeft een tegengestelde reeks bases te binden. Deze basen kunnen een grote verscheidenheid van verschillende combinaties te vormen en het is de combinatie van basen die de genetische code geeft. DNA wordt getranscribeerd messenger-RNA (mRNA), dat vervolgens wordt omgezet in eiwitten produceren.

Oligonucleotiden worden geïdentificeerd door hun ketenlengte. Zo zou een oligonucleotide dat ten nucleotide basen tien mer genoemd. Ze worden meestal chemisch gesynthetiseerd, en het soort synthese beperkt de ketenlengte van meer dan 60 basen lang.

In een soort DNA sequencing genoemd dideoxy sequencing worden oligonucleotiden gebruikt als een primer, zodat het enzym waardoor het DNA template te werken hebben. Enkelstrengs DNA wordt gebruikt, en een oligonucleotide dat complementair is aan de DNA-streng wordt gesynthetiseerd met een geautomatiseerde machine. Het DNA polymerase dat de DNA synthetiseert blijft toevoeging op de primer en synthetiseert de tegenoverliggende streng van DNA van het. Deze reactie produceert dubbelstrengs DNA.

Een meer recent gebruik van oligonucleotiden als primers in de polymerase kettingreactie (PCR) die wordt gebruikt om kleine fragmenten van DNA te amplificeren. Deze techniek heeft zeer praktische toepassingen, zoals in forensische en vaderschap testen. Het heeft ook een revolutie in het onderzoek in de geneeskunde en de biologische wetenschappen, omdat het vaak wordt gebruikt in genetische manipulatie experimenten.

Een reeks oligonucleotide probes wordt vaak gebruikt om genen te isoleren van een bibliotheek van genen of complementaire DNA (cDNA). cDNA-bibliotheken omvatten dubbelstrengs DNA, waarbij één streng is afgeleid van een mRNA-streng en de andere complementair aan. Dergelijke bibliotheken hebben het voordeel dat zij de openingen die regelmatig voorkomen in genen van hogere organismen.

De structuur van genen uit vele organismen bekend, door sequentiebepalingsprojecten en is openbaar. Wil men een gen uit een ander organisme te klonen, kan men zien wat er bekend is over het gen in andere organismen, en het ontwerp sondes op basis van gemeenschappelijke ruimtes in die sequenties. De onderzoekers hebben vervolgens een reeks van oligonucleotidesondes gesynthetiseerd die rekening houden met mogelijke variaties in de gemeenschappelijke ruimte. Ze screenen van de bibliotheek met die probes en kijk voor oligonucleotiden die binden. Vele genen zijn geïdentificeerd op deze wijze.

Een antisense oligonucleotide een enkele streng van RNA of DNA dat het complement van een sequentie van belang. Zodra een bepaald gen dat codeert voor een proteïne is gekloneerd, wordt antisense RNA vaak gebruikt om de expressie te blokkeren door te binden aan het mRNA dat zij synthetiseren. Dit laat onderzoekers bepalen de effecten op het organisme, wanneer dat eiwit niet maakt. Antisense oligonucleotiden worden ook ontwikkeld als nieuwe typen geneesmiddelen toxische RNAs blokkeren.

Microarray chips hebben een ander gebied waarop oligonucleotiden van groot nut zijn geweest. Dit zijn objectglaasjes, of een andere matrix, dat vlekken die duizenden verschillende DNA probes - in dit geval van oligonucleotiden. Zij zijn een zeer efficiënte manier om te testen op veranderingen in een aantal verschillende genen tegelijkertijd. Het DNA is gebonden aan een verbinding die van kleur verandert of fluoresceert, indien complementaire DNA bindt aan, zodat de vlekken van kleur veranderen wanneer er een reactie met het test-DNA.

Enkele dingen oligonucleotide microarrays worden gebruikt omvatten screening op genetische ziekten. Zo zijn er kleine sondes die de activiteit van genen betrokken bij borstkanker, BRCA1 en BRCA2 vertegenwoordigen. Het is mogelijk om uit te vinden of een vrouw een mutatie in één van deze genen en analyseren verder te zien of ze een aanleg voor borstkanker.

Er is een microarray genoemd ViroChip probes die ongeveer 20.000 genen van pathogene virussen die zijn sequentie heeft. Lichaamsuitscheidingen, zoals slijm, kan worden geanalyseerd met de chip, die vaak kunnen identificeren welk type virus een persoon is geïnfecteerd met. Het identificeren van virale infecties kunnen heel moeilijk omdat de symptomen vaak vergelijkbaar met verschillende soorten virussen.

  • Oligonucleotide een korte keten van DNA of RNA die kunnen worden gebruikt in de moleculaire biologie en geneeskunde.
  • Oligonucleotiden zijn nuttig bij biologisch en medisch onderzoek.

© 2019 Quilcedacarvers.com | Contact us: webmaster# quilcedacarvers.com